В период 1948—1953 год великий русский хирург был репрессирован, находился в заключении: сначала в тюрьме на Лубянке, а затем в одиночной камере в Лефортово, где перенёс второй инфаркт. Во время пребывания в тюрьме написал книгу «Размышления хирурга» — Сборник эссе на различные темы: творчество, литература, медицина, музыка, этика, проблемы хирургии.